截至2013年12月底，医学院设有7个院系，开办4个本科专业；共有教职员工和医护人员近16000人，在读医学生约5000人（其中本科生约2500人，硕士研究生1300余人，博士研究生1200余人，留学生500余人）。
临床医学专业八年制：实行“八年一贯、两段完整”的“4+4（，本博连读，4年非医类本科教育和4年医学教育）”培养模式。
临床医学专业五年制和口腔医学专业五年制：将有不少于150名优良学生直接进入“5+3”一体化培养，即本科毕业后直接进入该校与住院医师规范化培训有机衔接的3年临床医学硕士专业学位研究生教育阶段。经过3年临床医学硕士专业学位研究生培养和住院医师规范化培训，考核合格后，学生将获得硕士研究生毕业证书、硕士专业学位证书、执业医师资格证书和住院医师规范化培训合格证书。
预防医学专业五年制：培养掌握有系统的预防医学基本理论、基本知识和基本技能，具有相当实践能力、创新能力和国际化视野的预防医学高级专门人才，并成为未来公共卫生领域的实践者、研究者和领导者。
生物医学专业四年制：与英国爱丁堡大学签订生物医学“3+1本硕学位”培养项目，即在浙江大学学习3年，第4年赴爱丁堡大学学习1年，可获得浙江大学学士学位和爱丁堡大学硕士学位。