医院现有城中、阳湖、金东方三个院区，按照“做强阳湖，做精城中，做优金东方”的行动纲要，坚持院区和分院同质化管理，差异化发展。医院已与近20家医疗机构等形成了区域型、紧密型、专科共建型和对口帮扶型等多种形式的医疗联合体，并于2017年8月加入吴阶平医学基金会区域医疗协作体，有力推进分级诊疗和优质医疗资源下沉。

目前住院床位2200张，年门急诊总量221.53万人次，出院病人9.4万人次，手术4.4万例。在岗职工2826人，其中高级职称527人，博士、硕士学位651人。作为“国家级博士后科研工作站”，现有博士生培养点5个，硕士生培养点17个，博士生、硕士生导师89人。拥有江苏省青年医学人才10名，江苏省六大高峰人才4名，江苏省333高层次培养对象14名，常州市领军人才10名，拔尖人才10名。

医院科室设置齐全，技术力量雄厚。设有临床和医技科室57个，其中江苏省医学重点学科（共建）1个，江苏省医学创新团队（共建）1个，省级临床重点专科11个（含建设单位3个），南京医科大学医学重点学科1个，南医大校级重点实验室1 个，市级医学重点学科7个（含培育单位2个），市级临床重点专科30个。普外科、骨科、内分泌科、妇科、胸外科、心内科、呼吸内科、肿瘤科、放疗科的数十项技术在国内、省、市居领先或先进水平。近年来，医院组建了胃肠病中心、肿瘤中心、放射治疗中心、消化道肿瘤多学科诊治中心、代谢病诊治中心、无痛内镜中心、骨质疏松诊治中心、心肺诊疗中心等多学科综合诊疗中心，与上海中山医院、瑞金医院多学科诊疗服务中心结为协作医院；成为国家高级卒中中心，中国胸痛中心，建有创伤中心、房颤中心，开启一体化急救模式，打造区域急救中心；开设了糖尿病护理门诊、慢性伤口门诊、造口门诊、PICC门诊、影像介入与咨询门诊、助产士门诊、更年期保健医护联合门诊等特色门诊。

医院坚持科教兴院，成立黎介寿院士工作站、中国工程院孙颖浩院士常州工作站、中国工程院郎景和院士常州工作站，被列为国家卫计委腔镜培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、国家卫计委临床药师培训基地和国家药物临床试验机构，2017年I期临床试验中心投入使用。成为徐州医科大学、苏州大学、南通大学、江苏大学、蚌埠医学院等医学高等院校教学医院，并与常州大学合办护理学院，填补了常州本科护理高等教育空白。近五年来，各级科研项目立项232项，其中获国家自然科学基金22项，江苏省社会发展项目4项，江苏省自然科学基金6项，获江苏省卫生厅新技术引进奖13项，市科技进步奖18项，发表中华级论文145篇，SCI收录杂志论文376篇。

医院重视“信息化、智能化、人性化”建设，牢牢把握“互联网+”技术融合，启用全院自助服务体系、医院资源管理系统（HRP）、质量管控系统（HQS）、大数据平台和轨道小车物流传输系统等智能化应用系统，在提升医院整体服务水平的基础上，有效促进患者就医更便捷与医院精细化管理。

八十年来，常州市第二人民医院始终坚持“以病人为中心”的服务宗旨，秉承“爱院、爱岗、爱人、敬业、勤业、精业”的医院精神，实施科学管理、打造文化品牌。2017年建成吴阶平纪念馆，先后获得“全国精神文明建设工作先进单位”、“国家卫计委改善医疗服务示范医院”、“全国巾帼文明岗”、“全国青年文明号”、“江苏省文明单位”、“江苏省五一劳动奖状”、首批“江苏省文化建设示范点”、“常州市文明标兵单位”、“常州市科普教育基地”等称号，在香港艾力彼医院管理研究中心全国地级城市医院竞争力排名中连续三年入围百强医院。