新疆维吾尔自治区妇幼保健院始建于1951年，是集预防、保健、医疗、科研、教学、培训为一体的三级甲等妇幼保健机构负责自治区和乌鲁木齐市妇幼保健工作的业务管理，技术支持，国际、国内妇幼卫生项目执行等工作。

医院有两个院区，位于乌鲁木齐市南面的是二道桥院区，占地5.4亩，使用面积5.4万平方，开放床位400张；位于乌鲁木齐市北面会展片区的乌鲁木齐友爱（国际）医院是红光山院区，占地78亩，2018年一期投入使用，使用面积6万平方，开放床位450张。 医院设孕产保健部、儿童保健部、妇女保健部、计划生育技术服务部。

按照四大部功能任务、群众需求和机构业务发展需要开设妇科、产科、新生儿科、辅助生殖科、妇女保健门诊、日间手术室、中医妇科、儿童保健门诊、儿童康复科等47个科室，其中包括产前筛查、产前诊断、新生儿疾病筛查、新生儿重症转运、重症孕产妇救治、妇科疾病诊疗、生殖医学、盆底康复等8个中心。并设立与临床科室相配套的急诊、手术、人类精子库、医学影像、检验和病理等相关科室。

医院现有工作人员728人，其中，专业技术人员占95%，高中级职称医护人员占30%；开放床位400张，有北京协和医院、北京大学附属医院、东南大学附属中大医院、国家妇幼保健中心援疆专家常年坐诊。2016年医院获批国家自然科学基金依托单位，2017年成为自治区妇产科住院医师规范化培训基地。

截至目前，我院有自治区重点专科2个，乌鲁木齐市重点专科4个，培养了产前诊断人才、遗传与优生人才、辅助生殖人才，形成了良好的学科梯队，是全国孕产妇心身健康门诊研究员实习基地、产科麻醉培训基地、产前诊断培训基地、中医药工作示范基地、眼保健示范单位，自治区宫颈病变防治进修基地、盆底康复技术培训中心、导乐分娩培训基地、新疆医科大学临床教学基地。设有婴儿艾滋病早期诊断西北区域实验室、产前诊断重点实验室；是乌鲁木齐市妇产科质量控制中心。

医院先后荣获全国新生儿复苏项目组织优秀奖、全国青年文明号、全国巾帼文明示范岗、全国农村妇女两癌免费检查工作先进集体、全国百佳专科医院、 全国妇幼健康服务先进集体、全国百家爱婴医院、 自治区实施妇女儿童发展纲要先进集体、新疆60年卫生计生系统突出业绩单位等国家、省部、市级各项荣誉。