医院占地总面积40万平方米，江南院区8万平方米，松北院区32万平方米。开放床位3689张，现有职工3573人，其中中、高级职称专家1239人，硕士生导师、博士生导师162人。医院设置三级学科39个，88个临床病房，医学影像科为国家临床重点专科建设项目。优势学科包括普外科、口腔科、泌尿外科、麻醉科、心内科、医学影像科、感染科、消化科、神经内科、实验诊断科等。
 　
医院以“建设全面应用高新技术的现代化医院”为办院目标，引进大批世界先进的医疗设备：TOF-PET/CT/MR、640层CT（2台）、256层微平板CT、第二代宝石能谱CT、3.0T磁共振（4台）、1.5T磁共振（2台）、IGRT放疗仪、DSA（7台）等。医院完全具备了分子影像诊断、血管内窥镜应用、单孔的完全腹腔镜下的胰十二指肠的切除术、胸腔镜下的T4交感神经结的切断术及多学科诊疗模式下治疗大肠癌的转移等高新技术的能力。

医学影像科磷-31MR波谱分析及波谱成像在肝病（肝炎、肝硬化及肝癌）患者中的应用；心内科每年完成心脏介入手术例数6000例，2010年在国内应用Corsair微导管逆行操作技术治疗复杂冠脉CTO病变；耳鼻咽喉头颈外科BPPV诊疗系统在临床中应用；普外科门静脉结扎肝脏联合离断二步切除法（ALPPS）均在国际有影响；影像科低剂量螺旋CT小儿复杂先心病检查、320排CT前瞻性心电门控冠状动脉成像在心律失常患者上的应用；泌尿外科全腹腔镜下膀胱全切输尿管腹壁造口术、腹腔镜下前列腺癌根治术；产科导乐分娩镇痛；眼科1.8mm微小切口白内障超声乳化联合人工晶体植入术；整形科男-女性别重塑手术、自体口腔黏膜联合阴唇皮肤微粒移植阴道再造术；感染科乙型肝炎的母婴阻断等技术均在国内有较高影响。
 　
作为哈尔滨医科大学临床医学院，本科教育通过教育部本科教学工作水平评估、全球医学教育质量认证评估，目前承担以临床专业本科为主的4个轨道的本科教学任务，每年在院培养200余名博士、硕士研究生，300余名本科生、200余名住院医师、临床医师、临床药师。作为黑龙江省卫生专业技术人员继续教育培训基地，每年举办继续医学教育项目150余项。
　　
科研上成功立项247项省部级以上课题，获批国家重点基础研究发展计划项目(973计划)以及科技部国际科技合作项目等重大项目。发表高水平SCI文章681篇，单篇最高影响因子达到21.950。获得国家专利授权67项。医院先后主办了中华医学会第二十二届全国放射学学术大会、东亚国际心血管病高峰论坛、中俄泌尿外科学术研讨会、中国分子影像学高峰论坛等200余次高水平学术盛会，与美国哈佛大学、斯坦福大学、路易斯维尔大学、圣路易斯华盛顿大学、埃默里大学、美国国立卫生研究院、日本滋贺大学、韩国首尔大学、韩国东亚大学，加拿大、台湾等世界多个国家与地区的知名学府与医疗机构建立合作联系。